Die imposante Mönchskirche ist Teil der Klosterkirche und war früher ausschliesslich Mönchen und Geistlichen zugänglich. Bekannt ist das reich geschnitzte Chorgestühl. Wer genau hinsieht, erkennt verspielte Formen und teils überraschende Motive – etwa einen Hund, der Flöte spielt. Oder eine Katze, die sich die Ohren zuhält.
Die rechtwinklige Gliederung des Chorgestühls folgt ganz dem Stil der Renaissance. Gotische Elemente zeigen sich noch in den überlängten Gewandfiguren unter den Säulenarkaden. Im Zentrum des Hochaltars steht die Darstellung der Himmelfahrt Mariens.
Museum Aargau zeigt in der Mönchskirche ausgewählte Objekte aus seiner Sammlung, ergänzt mit Leihgaben der Katholischen Kirchgemeinde Wettingen. Zu sehen sind unter anderem Stücke aus dem Klosterschatz. Die Ausstellung ermöglicht so Einblick in die wechselhafte Geschichte des Klosters Wettingen – von der Gründung über die Klosterauflösung bis zur Gegenwart als Kantonsschule.
